Voyage dans l’univers microbiEn des sols de marseille
La science est plus indispensable que jamais pour comprendre et relever les défis du XXIe siècle. Pourtant, elle suscite parfois la défiance et demeure largement méconnue du grand public. Notre projet vise à rapprocher les citoyens, et en particulier les jeunes, de la recherche scientifique à travers des expériences immersives et participatives.
BIONEXTGEN est une plateforme de sciences participatives destinée aux lycéens. Elle leur offre l'opportunité de formuler une question de recherche, de concevoir un projet pour y répondre et d'en explorer toutes les étapes, de l'expérimentation à l'analyse des données. Les résultats obtenus sont ensuite interprétés et diffusés selon les standards de la recherche scientifique contemporaine.
NOTRE PROJET
C’est bientôt la saison de la baignade. Les Calanques ne sont-elles pas l’endroit idéal pour piquer une tête ? La mer y est d’un bleu profond et d’une transparence exceptionnelle. Pourtant, saviez-vous que le littoral marseillais a longtemps été marqué par une intense activité industrielle ? Depuis le XIXe siècle, certains secteurs côtiers ont été contaminés par des métaux lourds tels que le plomb, le zinc ou le cadmium.
Cette pollution fait aujourd’hui l’objet d’un suivi attentif et ses effets sur la faune et la flore sont étudiés depuis de nombreuses années. Mais qu’en est-il des micro-organismes ? Comment se sont-ils adaptés à cet environnement contaminé ? Participent-ils naturellement à la dépollution du littoral ? Et pourrait-on s’appuyer sur eux pour restaurer ces écosystèmes ?
Suivez notre enquête scientifique et découvrez avec nous ce qui se cache dans les sédiments des Calanques.
Tout commence ici
au lycée thiers
Suite à une présentation de Tâm devant les lycéens, le projet devient comme une évidence : intégrer les lycéens dans un projet de recherche pour qu’ils soient au coeur de l’action. Après un partenariat solide avec les proviseurs et les enseignants du lycée Thiers, nous commençons des ateliers de 2h le mercredi après-midi pour commencer à appréhender le monde de la recherche, et plus particulièrement celui de notre domaine d’expertise : la Microbiologie.
Notre méthode
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Pour mener cette exploration, nous mobilisons les outils les plus modernes de la recherche scientifique. Grâce à un budget dédié et à l'accès aux laboratoires du CNRS et d'Aix-Marseille Université, nous conduisons un véritable projet de recherche encadré par des scientifiques.
Nous collaborons avec des chercheurs en microbiologie, en écologie environnementale et en mathématiques. Par ailleurs, l'impact pédagogique du projet est évalué par des spécialistes des sciences de l'éducation afin de mesurer son effet sur les apprentissages, l'esprit critique et les vocations scientifiques.
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Nous construisons notre question de recherche à partir des connaissances actuelles en consultant la littérature scientifique. Les ressources documentaires du CNRS et des outils d'intelligence artificielle nous permettent d'explorer l'état des connaissances et d'affiner nos hypothèses.
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Nous sélectionnons des sites contaminés et des sites témoins afin d'évaluer l'impact de la pollution sur les communautés microbiennes. Ce choix s'appuie sur l'histoire industrielle des lieux et sur les connaissances géologiques disponibles. Nous réalisons ensuite des prélèvements directement sur le terrain.
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Nous analysons la composition chimique des sols, notamment leur teneur en métaux lourds. Nous extrayons également l'ADN des échantillons afin d'identifier les micro-organismes présents. Enfin, nous cultivons certaines bactéries au laboratoire pour étudier leurs capacités d'adaptation aux environnements pollués.
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Les données génétiques nous permettent d'identifier les espèces présentes, leurs interactions et les gènes impliqués dans leur adaptation. En comparant les sites contaminés et les sites témoins, nous cherchons à comprendre comment les communautés microbiennes répondent à la pollution et influencent leur environnement.
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Nous partageons nos résultats auprès du grand public, du monde éducatif et de la communauté scientifique à travers des présentations, des événements de médiation et des publications. Notre objectif est de contribuer à la production de connaissances tout en les rendant accessibles au plus grand nombre.
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L’équipe
“Les Pionniers”
Charlotte ORIOL
Coordinatrice du projet
Ingénieur
Tâm Mignot
Porteur du projet
Directeur de recherche CNRS
Alice CAMURI
Chargée de communication
Sortie terrain à la Calanque de Saména
Merci aux élèves de Seconde et de Première du lycée Thiers d’avoir acceptés de commencer cette aventure BioNextGen avec nous.
un grand merci à Elise, Hanane, Manon, Emilio, Salma, Niouma, Lucas, Gabriel, Adam, Joachim, Sophia, Marco et NACef.
Merci à l’équipe adef d’avoir été présente lors des ateliers : Jérémy, magali, éléna et brice.
Rejoindre notre équipe
Les lycéens prennent la parole
Qu’est-ce qu’il t’a le plus surpris ?
Gabriel
Qu’est-ce qu’il t’a le plus surpris ?
La facilité à mener un projet de recherche quand on nous explique les outils.
Qu’est-ce qu’il t’a le plus plu ?
Les expérimentations : de la sortie terrain pour récolter les échantillons jusqu’à l’extraction d’ADN au laboratoire.
Manon
Le nombre d’intervenants, et de personnes impliquées dans ce projet.
Qu’est-ce qu’il t’a le plus plu ?
L’autonomie qu’on nous offre, nous lycéens à développer les axes d’étude de ce projet.
Les partenaireS
L’équipe “Les Pionniers”
Des données qui racontent une histoire
Notre première sortie terrain en mai 2026 nous a permis de collecter des échantillons de sol de trois sites dans les Calanques de Marseille. La composition physico-chimiques de ces échantillons a été analysée en collaboration avec le Laboratoire de Chimie Environnementale (Aix-Marseille Université). Ces résultats préliminaires témoignent du passé industriel de cette zone malgré une dépollution de la calanque de Saména
sols contaminés des calanques
Etude du microbiome du sol des calanques
Analyse métagénomique (séquençage shotgun)
